全ての物質が電詞情報として変換され、再構築された都市DT。そこはかつて大神を降誕に失敗し、一度記憶を封じられた都市である。
　日本政府の特殊部隊班長の青江は、重犯罪者アルゴを追い、自らも犯罪者という身分を偽装してDTに入市する。だが、DTは神の信託を降ろす預言塔BABELの起動や、封じられた記憶の公開を間近に控えていた。
　青江は、DTを治める十三亜神の一人であり、自分の後輩であった優緒と再会して捜査を進める。
　しかし、アルゴは亜神の一人エダムザと共謀し、王城を占拠。過去DTを壊滅の危機に陥れた神の降臨を再び起こそうとしていた……。