連邦軍の技術将校を父に持つアムロ・レイ。彼は人工の大地「サイド７」でジオン軍の襲撃に遭い、父の開発したガンダムで応戦する。そして避難民としてＷＢに乗るが、次第に戦争に巻き込まれていく。