宇宙世紀００７８、ジオンと連邦政府間の緊張が高まる中、月面では史上初のＭＳ同士による戦闘が始まる。敗北を喫した連邦軍は「ＲＸ‐７８ガンダム」の開発計画を発表し、運命の宇宙世紀0079をむかえる……。