世界には魔法少女と呼ばれる者達がいる。それは強化歩兵。アウトフィットという強化装備を纏った少女達だ。
　アウトフィット開発で名高い綾笠直営の綾笠付属学院。そこに二人の転校生がやってきた。小柄で人形のような愛らしい少女、ひょうひょうとした笑顔を絶やさない少年。珍しい転校生ではない。だが、彼らは特別に召集された極秘プロジェクトのメンバーだった。それは“本物”の魔法少女を生み出すというもので!?