魔術と超能力を駆使して戦う学園アクション第3弾！真夏の夕暮れ。 補習帰りに自動販売機に金を呑まれた上条当麻。カツッと革靴を鳴らしながら、上条に声をかける御坂美琴。そこに偶然通りかかる美琴にそっくりの御坂妹。何気ない放課後……。これが一方通行と呼ばれる超能力者が起こす殺戮劇の幕開けになるとは、3人はまだ知る由もなかった――。