世界を再構成し、あらゆる魔法少女をハッピーエンドへと導く究極の魔法。最強の魔法少女“必殺の弾丸”ほのかは、自らの恋のためにその救いを拒否し──世界を、滅ぼした。
　彼女の願いのままに再生された軋む世界で、〈魔法少女〉の魔法少女はほのかの恋人・牧瀬琢磨に最後の機会を与える。 魔法少女として再構築された琢磨と真音。魔法少女を巡るシステムと対峙した彼らは、世界の終わりを回避するのか、それとも──これは終わり損ねた全ての魔法少女たちの、終局と再生の物語。