“位相術”――それは、この世界とは少しずれた別位相世界にある特殊な力《エーテル》を取り出して行使する、魔法のような術。その《エーテル》をエネルギーとして利用する実験都市・武蔵原へ六年ぶりに帰ってきた北斗は、街へ着いた途端に異形に襲われる。そんな彼を救ったのは、レザージャケットにボンデージのような露出度の高い服という奇抜な出で立ちの少女・燎子だった。彼女は“位相術”を操る位相術士〈エクスフェイザー〉だという。戦いに巻き込まれてしまったことで、強制的に位相術士たちの世界に関わることになった北斗。そこで、彼は自らの運命を知っていくこととなる――。運命が錯綜するヘヴィなEX〈エクストラ〉バトルアクション、ここに誕生！