史上最高ステータスの最強Ｓランクとして第一魔法騎士学園に入学した白銀雪奈の父・冬真は、陰の特殊部隊のエースを担い人知れず世界の平和を維持していた。
だが、学園を統べる統括生徒会長グラン・マリアの謀略により人類の半数以上が敵に回り、愛娘・雪奈と刃を向け合う状況に陥ってしまい……？　
一方、囚われのカチュアやロンメルは各々に暗躍し、黒子やアレイナも己が役割を果たすため動き出す。
「俺は全てを殺してきた。人類も、胞子獣も、そして俺自身すらも。絶対のルールを、縛りを破らねばならない相手は――君が、初めてだ」
最愛の娘、大切な仲間のため、人類存亡の危機を前に、無敵の父が真の実力を解放する！