この物語は、嘘（フィクション）ということになっている――時は西暦2020年。世界全てが求める神秘〈コスモギア〉を巡りスパイが跋扈する街〈統京〉で、二人は出逢う。
"500年前"から時を超えた「くノ一」澪。
"500年後"から時を遡った「改変者」零。
　お互い違う思惑を持ちながらも、世界の破滅を招く《宇宙改変》阻止のために偽りの兄妹契約を結んだ二人。
　その任務は――時を遡る腕時計〈永劫〉を観る少女《紅の瞳の観測者》に近づくため、教師と生徒として学園に潜入することだった！
「おい、リビングで手裏剣やめろ!?」
「だって兄上が映画ばかり見るから！」
　歳の差千年、家庭は犬猿、それでも世界を救えるか？
　愛で騙して未来を創る、超時空スパイフィクション、上映開始！