遠い未来。環境汚染の激化により地表での生活を諦めた人類は、地下に掘った巨大な縦穴【地下都市】での生活を余儀なくされた。
主人公「よたか」は、3層で構成される【地下都市】の中で最も深部の区画で生活する少年。
彼が生活する区画は、本来【地下都市】の廃棄物を集積するために作られた場所だった。
ある日、いつものように上部区画で廃棄され落下してきたゴミを漁る「よたか」。彼が見つけたものは、壊れかけで記憶もない一体のアンドロイドだった－－－。
ひとりの少年と、アンドロイドの出会いで、物語は動き出す。
「ねぇ、探しに行こうよ。君の失った全てを－－－！」