Dr.ワイリーとの戦いから月日が経ち、ロックマンは平和な世の中で大人になった。ライト博士が開業した歯科医院で歯科医として働くロックマン。しかし、ロボットによる事件が多発するようになり、彼は自らの力で世界を守ることを選択する。そして、事件の黒幕を暴こうとするロックマンの前に現れたのは――!?