“監督”による映画館閉じ込め騒動も終わり、日常へ帰還したフラグちゃんたち。賑やかなフラグ回収の練習が再開──と思いきや、モブ男の身体に異変が起きる。モブ男が元々持っていた『バグ』が想像以上に深刻化し、身体が崩壊し消え始めていたのだ！　助けを求めるも神様すら修復が不可能なエラー。このままでは完全に存在が消去〈デリート〉してしまうモブ男を、フラグちゃんは何とか助けようと試みる！　
神様も諦めず、一緒に『仮想世界』を作った死神No.1に協力を依頼する。
しかし、死神No.1こそがモブ男のバグを悪化させた張本人で──!?