北町奉行所の同心の次男として生まれた富永甚四郎は、蘭方医になるべく大槻玄沢の芝蘭堂で学んでいた。ところが長男が流行り病で急逝、突如同心を継ぐことになった。しかも面番所は吉原。まったく知識のない遊郭のしきたりに戸惑いながら任務に赴いた矢先、妓楼で遊女が殺害された。検使に向かった甚四郎が蘭方を用いて遺体を調べると、死因は絞殺らしい。犯人は常連客なのか？　吉原で起こる難事件に甚四郎が立ち向かう！