東京から南に遠く離れ、太平洋に浮かぶメガフロート集合体・海上新都心。最新のハイテクで作られた街だが、ドローンや自動運転車だらけの街には不釣り合いな闇が隠れている。
　戮霊、死者の強い怨みが霊に突然変異した存在だ。
　内気な女子高生八尋殿つむぎは地元の神社再興のため、オンライン巫女として人知れず戮霊退治の依頼を受けるのだが……？
「むぎっこ、スマホの画面丸見えなんだけど？」
「にゅわあッ！　あ、あなたには関係ないじゃない……（ボソボソ）」
　海の上の街を舞台に、オンライン巫女つむぎと少女たちのちょっと変わった日常と熱帯夜の戦いが幕を開ける！？