怪盗ダークがクラッドと共に「黒翼」に戻り十数年。いつしか、その絵画の中から二人の姿は消え、しかし「丹羽」の中にもダークは目覚めないままでいた。
「伝説の怪盗ダーク」に憧れを抱く丹羽大夜（ダイヤ）は、双子の日渡兄弟と共に、「生きている美術品」を探し求める毎日。
一方、大夜の世界と対をなす「並行世界」では、丹羽家最後の生き残りである丹羽ダイアが、命をかけて化け物と化した美術品の回収を行っていた。
ふたつの世界に2人の丹羽。そしてちらつく「白い羽根の魔物」。ダークの目覚めは叶うのか―――！？