姫巫女による魔獣たちの台頭と暴走を食い止めた軍神カイとその妻サクラ。それから５年の歳月が過ぎ、二人は双子の男の子クオと女の子シオンとの平穏な日々を過ごしていた。そんなある日、竜の生息地を抱えるシュバルツ領の公爵危篤の報を受け、カイとサクラは領を訪れる。そこでカイは、竜に仕える伝説上のデシール一族と出会う。三種の神器誕生の秘密を握る「始りの王」と、その王に一時的に体を奪われたカイ。二人の狭間で揺れるサクラは――。