名家の子息たちが通う一ノ宮学園。雪丸蓮（ゆきまるれん）はその高等部の一年生だ。
ある日の放課後、蓮は帰り道で一軒のベイカリーを見つける。
街の死角にひっそりと佇むその深緑の小さな店には「Meli（メーリ）」と書かれた看板が飾られていた。
ひょんなことから店主の榧木（かやぎ）と知り合いとなった蓮だが、ただのベイカーとは思えない榧木の洞察力により、とある悩みを打ち明けることになって……。

クロワッサン、シュークリーム、サンドイッチ、フォカッチャ。
焼き立てパンと焼き菓子に謎の香りを添えた、美味しいベイカリー・ミステリ！

◆登場人物
・雪丸蓮（ゆきまるれん）
一ノ宮学園高等部一年生。真面目な性格。
訳あって父親と二人暮らし。

・榧木（かやぎ）
ベイカリー「Meli」の店主兼オーナー。どこか貴族然としている。
ベイカーとは思えない洞察力の持ち主。

・東城公央（とうじょうきみちか）
蓮のクラスメイト。剣道部所属。明るい性格で社交的。