確実に殺されたはずの主人公・芦原佑馬は、なぜか傷一つない状態で奇跡の蘇生を遂げた。
しかし、安堵する間もなく、クラス委員の須鴨によって理不尽な「学級裁判」が開廷されてしまう。
秩序を乱した罪として、ユウマたちは暗黒に包まれた危険な地下エリアの電源復旧ミッションへと駆り出される。
そこで待ち受けていたのは、暴走した最強の召喚獣であり、哀しき運命に囚われたかつての少女だった――

過酷な運命に立ち向かう少年の誓いと覚醒を描く、緊迫の新章突入！